Pesantren Media menggabungkan pembelajaran tsaqafah Islam dan teknik media. Pada kegiatan hariannya, ibadah dan adab menjadi penekanan untuk diaplikasikan oleh seluruh santri. Setiap pekan, terjadwal berbagai mata pelajaran teknik media dan tsaqafah Islam. Santri belajar teknik media yang meliputi: menulis dasar, penulisan skenario, fotografi, desain grafis, editing audio, editing video, jurnalistik visual, website praktis, public speaking, olah vokal dan instrumen musik.
Tsaqafah Islam disusun terjadwal setiap hari dan setiap pekan untuk dipelajari dan diamalkan para santri, di antaranya: tahfidz al-Quran, tahsinut tilawah, akidah, adab, sirah nabawiyah, tata pergaulan pria-wanita, tafsir al-Quran dan hadits, tazkiyatun nafs, fiqih, roblematika anak muda, dan bahasa Arab.
Selain itu, santri juga belajar matematika, sains untuk kesehatan dan pengobatan, dan bahasa Inggris.
Olahraga juga menjadi agenda rutin untuk menjaga kesehatan jasmani para santri.